Study on USP39 mediated Regulation of Oncogenic Transcription Factor ETS2
- 발행기관 서강대학교 일반대학원
- 지도교수 김종찬
- 발행년도 2024
- 학위수여년월 2024. 2
- 학위명 석사
- 학과 및 전공 일반대학원 생명과학과
- 실제URI http://www.dcollection.net/handler/sogang/000000076865
- UCI I804:11029-000000076865
- 본문언어 영어
- 저작권 서강대학교 논문은 저작권 보호를 받습니다.
초록
The ETS transcription factor family, characterized by a conserved ETS domain, plays a vital role in the regulation of gene expression in various biological processes. ETS2, a key member of this family, is known to influence cell growth, differentiation, and development. Dysregulation of ETS2 has been linked to numerous diseases, especially cancer. Precise control of ETS2 is achieved through post-translational modifications, including ubiquitination, which impacts its stability and function. Ubiquitination, a reversible process, finely tunes protein stability and activity. E3 ligase COP1 promotes ETS2 ubiquitination, leading to its proteasomal degradation. Deubiquitinases (DUBs) counterbalance this process. Traditionally, USP39, a member of the USP family, has been associated with RNA splicing but was considered devoid of deubiquitination activity. Recent studies have unveiled its deubiquitination activity on various key proteins. In this study, a novel DUB that interacts with ETS2 was identified. The research investigates the impact of this DUB on ETS2, shedding light on ETS2 regulation and its potential implications in cellular processes. These findings contribute to our understanding of ETS2's role in gene expression regulation and its relevance in disease mechanisms.
more초록
ETS 전사 인자 집단은 일정한 ETS 도메인을 가진 전사인자들로 이루어 져 있으며 다양한 생물학적 과정에서 유전자 발현 조절에 중요한 역할을 한다. ETS2는 이러한 패밀리의 주요 구성원 중 하나로, 세포 성장, 분화 및 발달에 영향을 미치는 것으로 알려져 있다. ETS2의 조절장애는 암을 비롯한 다양한 질병과 관련이 있다. ETS2는 번역 후 변형을 통해 정밀하게 제어된다. 이 중 에서 유비퀴틴화는 안정성과 기능에 영향을 미친다. 유비퀴틴화는 가역반응으 로, 단백질 안정성과 활동을 정밀하게 조절한다. E3 ligase인 COP1은 ETS2 유비퀴틴화를 촉진하여 단백질 분해를 유도한다. 탈유티퀴틴화 효소(DUB)는 유비퀴틴을 제거한다. USP 패밀리의 일원으로 알려진 USP39는 RNA splicing과 관련됐으며, 활성 cysteine 잔기가 없어 탈 유비퀴틴화 능력이 없 다고 여겨졌다. 하지만 최근의 연구에서 USP39가 다양한 단백질에 대한 탈 유비퀴틴화를 일으켜 안정성을 유지하는 능력이 있음이 밝혀졌다. 본 연구에 서 ETS2와 상호 작용하는 새로운 탈유비퀴틴화 효소를 선별했다. 본 연구는 이 DUB가 ETS2에 미치는 영향을 조사하며, ETS2의 조절 및 세포 과정에서 의 잠재적인 영향을 밝혀내고 있다. 이 결과는 ETS2의 유전자 발현 조절에 서의 역할과 질병 메커니즘에 대한 우리의 이해에 기여할 것이다.
more목차
Introduction 1
Materials and Methods 4
Cell Lines 4
Plasmids 4
RNA Interference 5
Immunoblotting 6
Site-Directed Mutagenesis 7
Immunoprecipitation and Pulldown Assays 7
Deubiquitination Assay 8
Luciferase Reporter Assay 9
Cytoplasmic and Nuclear Fractionation Assay 9
Cycloheximide Chase assay 10
Gene Expression Omnibus (GEO) Repository Dataset Analysis 10
Statistical Analysis 11
Results 13
Identification of DUBs interacting with ETS2 13
Identification of DUBs regulating transcriptional activity of ETS2 17
USP39 interacts with and suppresses transcriptional activity of ETS2 21
ETS2 interacts with USP39 through its amino-terminal region 25
USP39 interacts with ETS2 through its amino-terminal region 28
USP39 deubiquitinates ETS2 31
USP39 does not impact ETS2 stability 35
USP39 inhibits transcriptional activity partially due to suppression of ETS2 nuclear localization 38
USP39 differentially regulates ETS2 compared to USP7 42
USP39 knockdown reverses ETS2 transcriptional inhibition 46
Discussion 50
References 56
