Genetic association studies for asthma and inflammatory demyelinating diseases in Korean cohorts
- 발행기관 서강대학교 일반대학원
- 지도교수 신형두
- 발행년도 2016
- 학위수여년월 2016. 2
- 학위명 박사
- 학과 및 전공 일반대학원 생명과학과
- 실제URI http://www.dcollection.net/handler/sogang/000000058898
- 본문언어 영어
- 저작권 서강대학교 논문은 저작권보호를 받습니다.
초록/요약
Genetic variations occur in 0.1% of human genome and causes heritable diversity such as disease susceptibility in a human population. Genetic association studies including candidate gene approach and genome-wide association study have been performed by many researchers to find genetic factors that contribute to disease risk. Genetic association studies with asthma including AERD and ICS responses and IDD were conducted. First, it was evaluated the associations between the genetic polymorphisms of SLC22A2, ANXA4, and DCBLD2 and the risk of AERD in a Korean population. A total of 18 SNPs in SLC22A2, 21 SNPs in ANXA4, and 12 SNPs in DCBLD2 were analyzed for association. As a result, 10 SNPs and 2 haplotypes in SLC22A2, 7 SNPs and 2 haplotypes in ANXA4, and 2 SNPs and one haplotype in DCBLD2 showed the association with AERD. The results suggest that the three genes might be associated with AERD. Second, the genome-wide association and follow-up study for FEV1 decline by ICS was performed in Korean asthmatics. In a genome-wide study, it has been identified the lowest P-value in ALLC, but none of the SNPs met the genome-wide association criteria (P < 1.0 × 10-8). However, among 25 SNPs on ALLC in the follow-up study, six variants showed significant associations with the mean %ΔFEV1 in the study subjects. Although the limitation of this study due to small sample size, our results suggests that associated SNPs of ALLC might be genetic predictors of response to ICS, at least with respect to ΔFEV1 in Korean asthmatics. Third, based on the previous reports, it was suspected that the polymorphisms of CD6, TNFRSF1A, IRF8, and AQP4 might be associated with IDD, including MS and NMO, and performed association analyses in a Korean population. One SNP in CD6 and 3 SNPs in TNFRSF1A were associated with NMO. However, there was no association of IRF8 and AQP4 polymorphisms with IDD, including MS and NMO. Considering the previous results suggested in European or African populations, further replication in larger populations or other ethnic groups are required.
more초록/요약
인간의 유전체에는 약 0.1% 의 유전 변이가 존재하며 이러한 변이는 질병에 대한 위험도 등에 개인 간의 차이가 발생하는 원인이 된다. 후보 유전자 연구 및 전장 유전체 연관성 분석 등 질병에 대한 유전적 소인을 밝혀내기 위한 연구들이 연구자들에 의하여 진행되어 왔다. 본 연구에서는 천식 및 염증성 탈수초 질환 (IDD)의 유전자 연관성 연구를 진행하였다. 첫 번째로, SLC22A2, ANXA4, DCBLD2의 유전 다형성이 한국인 집단 내에서 천식의 일종인 아스피린 과민성 호흡기 증후군 (AERD) 발생에 영향을 주는지 연구하였다. 그 결과, SLC22A2의 10개 SNP 및 2개 일배체형, ANXA4의 7개 SNP 및 2개 일배체형과 DCBLD2의 2개 SNP 및 1개 일배체형이 AERD와 연관성을 보였다. 이 결과로 볼 때, 세 유전자는 AERD와 연관성이 있을 것으로 추정된다. 두 번째로, 천식 환자 집단 내에서의 흡입용 스테로이드 (ICS) 반응에 연관된 유전 변이를 발굴하기 위하여 첫 단계로 전장 유전체 연관성 분석을 수행한 결과, ALLC 유전자의 SNP에서 ICS 처방으로 인한 FEV1의 변화량과 가장 강한 연관성을 보였으며 그 다음 단계의 follow-up 연구를 통하여 이러한 연관성을 보이는 ALLC의 SNP 6개를 추가적으로 발견하였다. 작은 크기의 표본으로 인한 연구의 한계점은 있으나, ALLC의 SNP가 한국인 천식 환자 집단에서 ICS 반응에 대한 유전적 예측 요소로 제안되었다는 점에서 의미 있는 결과라고 볼 수 있다. 세 번째로, 기존의 연구로부터 CD6, TNFRSF1A, IRF8, 및 AQP4의 유전 다형이 다발성 경화증 (MS) 및 시신경 척수염 (NMO)를 비롯한 염증성 탈수초 질환 (IDD)의 위험성과 관련이 있다고 의심되어 한국인 인구 집단을 대상으로 연관성 연구를 수행하였다. CD6의 1개 SNP와 TNFRSF1A 의 3개 SNP가 NMO와 연관성을 보였으나 IRF8 와 AQP4에서는 어떠한 SNP도 MS, NMO를 포함한 IDD에서 연관성을 보이지 않았다. 유럽인과 아프리카인을 대상으로 한 이전 연구 결과를 감안할 때, 이 유전자들에 대한 더 큰 인구 집단 혹은 다른 인종을 대상으로 한 추가적인 연구를 할 필요가 있다.
more