Genetic Association of PARP15 and ZBTB46 Polymorphisms with Acute Myeloid Leukemia in a Korean Population
- 발행기관 서강대학교 일반대학원
- 지도교수 신형두
- 발행년도 2016
- 학위수여년월 2016. 2
- 학위명 석사
- 학과 및 전공 일반대학원 생명과학과
- 실제URI http://www.dcollection.net/handler/sogang/000000058826
- 본문언어 영어
- 저작권 서강대학교 논문은 저작권보호를 받습니다.
초록/요약
Poly (ADP-ribose) polymerases (PARPs) and zinc finger and BTB domain–containing (ZBTB) proteins are involved in a wide range of cellular processes including DNA repair and transcriptional regulation. Some members of the PARP and ZBTB families have been actively researched in genome-wide association studies of various diseases and regarded as targets for the therapeutic inhibition of cancer. Among these proteins, PARP15 and ZBTB46 are also potential candidate genes for cancer development due to their ability to regulate gene transcription and reported association with apoptosis. The current study investigated the possible association between PARP15 and ZBTB46 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) and the risk of acute myeloid leukemia (AML). Furthermore, I analyzed the genetic effects of PARP15 and ZBTB46 on the clinical phenotypes based on cytosine arabinose (Ara-C) chemotherapy in AML patients. A total of 35 SNPs (10 for PARP15 and 25 for ZBTB46) were genotyped using a TaqMan assay in a total of 362 Korean subjects including 121 AML patients and 241 normal controls. The genetic effects of the polymorphisms on the risk of AML and the clinical phenotypes were analyzed using SAS software. The results from logistic regression analysis revealed that none of the polymorphisms was associated with AML susceptibility and the outcome of chemotherapy in AML patients (Pcorr > 0.05). However, in Cox regression analysis, six polymorphisms (two for PARP15 and four for ZBTB46) were associated with overall survival. One signal of these SNPs was retained after multiple test correction (Pcorr < 0.05). Our results showed that the PARP15 and ZBTB46 polymorphisms were not significantly associated with the risk of AML and AML clinical phenotypes in a Korean population. However, although our results require further study to validate these marginal signals, PARP15 and ZBTB46 may be potential therapeutic targets or markers for AML patients.
more초록/요약
급성 골수성 백혈병 (Acute Myeloid Leukemia, AML) 은 미성숙한 백혈구의 수가 급격하게 증가하여 발병하며, 생존률이 낮은 질환이다. 급성 골수성 백혈병의 주된 치료방법은 항암화학요법(chemotherapy)으로, 이 때 가장 많이 쓰이는 약물은 Cytosine arabinoside (Ara-C) 이다. Ara-C의 작용 매커니즘은 백혈병 세포 (leukemia cell)의 세포예정사 (apoptosis) 를 유도하는 것으로 알려져 있다. 한국인에서 급성 골수성 백혈병의 진단 및 예후 마커를 확인하기 위하여 121명의 AML 환자군과 241명의 건강한 한국인을 대상으로 연관성 연구를 진행하였다. 질병관련 잠재적 후보유전자로 선정된 PARP15와 ZBTB46 유전자에 위치한 총 35개의 유전변이에 대하여 TaqMan assay를 통하여 genotyping 실험을 수행하였다. 또한, 통계분석을 통하여 유전변이와 급성 골수성 백혈병의 발병 위험도와의 연관성을 분석하였고, 항암화학요법의 결과에 근거하여 예후마커로서의 가능성을 확인해보았다. 35개의 PARP15 와 ZBTB46의 유전변이 중 발병 위험도 그리고 항암화학요법 결과와 연관성을 보이는 유전변이가 확인되었다. 또한, 생존분석결과 2개의 PARP15 유전변이와 4개의 ZBTB46 유전변이가 생존률과 연관성이 있는 것으로 분석되었다. 뿐만 아니라 6개의 유전변이의 유전자형 조합에 따른 생존률도 유의미한 차이를 보였다. 이러한 결과들을 검증하기 위하여 추가적인 연구가 필요하지만, 이 연구는 한국인에서의 급성 골수성 백혈병의 진단과 예후 마커로서의 PARP15와 ZBTB46의 가능성을 제공할 수 있을 것이다.
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