구아니디네이션 처리된 라이신 곁사슬을 포함하고 있는 펩타이드의 FRIPS (Free radical initiated peptide sequencing)분석법
- 발행기관 서강대학교 자연과학대학원
- 지도교수 오한빈
- 발행년도 2010
- 학위수여년월 2010. 2
- 학위명 석사
- 학과 일반대학원 화학과
- 실제URI http://www.dcollection.net/handler/sogang/000000045763
- 본문언어 한국어
- 저작권 서강대학교의 논문은 저작권에 의해 보호받습니다
초록/요약
TEMPO-FRIPS method is previously shown to be another complementary tandem mass spectrometry tool useful for peptide sequencing. In TEMPO-FRIPS, however, a TEMPO radical initiator is also often attached to a lysine side chain as well as to a desired N-terminus, which often hampers peptide sequencing. To overcome this drawback, guanidination of a lysine side chain is sought. Initially, lysine side chains are guanidized and then a TEMPO initiator is attached to the N-terminus. The peptides prepared in this way is further subjected to tandem mass spectrometry. As well as free radical initiated peptide has totally different CID pattern from other ordinary peptide, guanidized free radical initiated peptide also shows fragmentations in single and multiple side chains rather than b and y fragments. In this dissertation, we will show the detailed experimental procedure for this experiment and fragmentation pattern of guanidized Free radical initiated peptide. And from these certain results, I confirmed this experiment is performed successfully.
more초록/요약
TEMPO-FRIPS 분석법은 또 하나의 상호보완적인 연속질량분석법으로 앞서 펩타이드의 서열분석에 유용한 도구임을 보였다. 그러나 TEMPO-FRIPS에서 템포 라디칼 개시제는 의도한 N말단기 뿐 아니라 또한 라이신 곁사슬에 빈번히 붙기에 펩타이드 씨퀀싱에 방해요소가 된다. 이 문제를 극복하기 위해서 라이신 곁사슬을 구아니디네이션하는 방법을 구상하였다. 우선 라이신 곁사슬을 구아니디네이션한 후 템포 개시제를 N 말단기에 붙인다. 이렇게 준비된 펩타이드는 연속질량분석의 대상이 된다. 자유라디칼로 개시되는 펩타이드는 여타 일반적인 펩타이드와 확연히 다른CID분해양상을 보이는 것과 마찬가지로 구아니디네이션된 자유라디칼 개시 펩타이드는 또한 b, y이온이 아닌 하나 혹은 그 이상의 곁사슬이 분해되는 양상을 보여준다. 우리는 이 논문에서 이 실험의 자세한 과정과 구아니디네이션 처리된 자유라디칼 개시 펩타이드의 분해양상을 다룰 것이다. 그리고 이 결과들을 통해 펩타이드의 구아니디네이션이 완벽하게 이루어진 것을 확인하였다.
more