서강대학교

초록/요약

최근 휴먼게놈 프로젝트가 성공적으로 수행됨에 따라 생명체에 대한 게놈 수준의 정보가 전례 없이 증가하였다. 하지만, 활발한 생명과학/공학 분야의 연구들을 통하여 게놈 수준의 이해를 초월한 생명정보의 생체 내 구현형태인 단백질체(Proteome) 수준에서의 이해가 필수적이라는 점을 인식하게 되었다. 이러한 배경 하에 소위 단백질체학(Proteomics) 이라고 불리는 새로운 학문 분야가 탄생했다. 이 단백질체학에서 주요한 실험적 도구로써 질량분석법이 자리를 매김하고 있는데, 특히 가장 고질량분해능을 자랑하는 Fourier Transform(FT) 질량분석법이 최근 들어 많은 주목을 받고 있다. 하지만, 이 FT 질량분석기에서 얻어지는 고집적(data intensive) 질량분석스펙트럼을 분석하는 소프트웨어의 개발 및 활용 수준은 비교적 낮은 분해능을 가진 저집적 질량분석스펙트럼 분석에 비해 초기단계에 지나지 않는다. 특히 단백질체학 및 바이오인포매틱스 분야에서 해결해야 할 주목받는 과제로써 고속 질량분석 및 해석을 들 수 있다. Horn et al. [1] 에 의하여 개발된 THRASH는 전기분무 (electrospray ionization: ESI) [2] 질량 스펙트럼(ESI-mass spectrum) 데이터를 인간의 도움 없이 자동으로 분석해주는 프로그램이다. 하지만 아직 THRASH의 질량 스펙트럼 분석 속도는 방대한 양의 단백질 질량스펙트럼 데이터에 비해 아직 느린 편이기 때문에 본 논문에서는 THRASH가 갖는 문제점을 분석하고 분석 결과를 바탕으로 기존 THRASH의 정확성을 거의 손상시키지 않으면서 THRASH의 질량스펙트럼 분석 속도를 4배 이상 비약적으로 향상시키는 기법을 제안하고 실험을 통해 성능을 확인한다.